就在刚刚，琉星察觉到了，碇源堂已经将琉星替换掉的那份亚当之卵融入了自己的身体。
不出意外的话，他下一步的动作就是对绫波丽出手了。
没想到因为自己的参与，零号机都没能登场过几次，不，或者更准确地来说，碇源堂有意保护着绫波丽。
琉星知道，在绫波丽的身体中，有着莉莉丝的灵魂。
亚当的卵、莉莉丝的灵魂在加上NERV本部的最下层禁区中央教条中的莉莉丝的残躯，就能够达成另一种条件。
时间再次飞逝而过！
不久之后，第九使徒来袭！
这一刻琉星察觉到异常，如果说之前的剧情都是按照旧版动画来走的话，那么这一次却是按了剧场版。
三号机被从漂亮国运输到霓虹进行测试，SEELE组织决定放弃前面的机型，使用三号机进行作战。
当真正的新世纪福音战士诞生，她和莉莉丝的复活将迎来最后的契约，不过在那之前有必要去进行仪式。
零号机、初号机、二号机等等，以及其他的机型，都是试验品中的一员。
SEELE想要从中找出能够觉醒的机型，所以才会迫不及待的启动三号机。
“一切都会按照SEELE的剧本进行，真正的新世纪福音战士包括初号机在内的所有机型，都是为了完成它开道罢了！”
碇源堂的声音十分低沉。
“他们指的是Mark.06吗？不在是虚假的神，而是想要创造出真正的神！”身后的冬月问道。
“是啊，看来必须想办法尽快让初号机觉醒！”
“不过琉星那边，恐怕我们的一切也逃不过那种家伙的监视吧！”
“无所谓，既然他不打算对我们动手，说明内心还有其他疑虑，或者说我们不值得他关注。”
空旷的大厅中，碇源堂和冬月两人进行着对话。
——
“有趣，二号机被冻结了，所以让明日香去作为三号机的测试员！”听着葛城美里的诉说，琉星自然也猜到了碇源堂的意图。
这老痞子是想要把明日香逼上绝路，然后刺激初号机中的碇真嗣。
毕竟对于碇真嗣、绫波丽以及明日香这些内心有问题的孩子来说，刺激他们灵魂深处的恐惧，更容易让初号机觉醒。
何况是在琉星的教育下，这三人的关系也非常不错，每个人的内心也有了很大的成长。
有时候得到的越多，失去的时候，反而会更加痛苦，这一点碇源堂倒是要谢谢琉星。
记得当年看这一幕的时候，那真的恨不得给导演寄刀片了。
想拿明日香当工具人，琉星自然不会让这个老痞子得逞。
傍晚时分，琉星将三人组以及葛城美里都叫到自己的房间中，这让所有人察觉到怪异。
琉星将自己的想法告诉了众人。
“怎么可能，碇司令真的会做那种事情吗？”
“我也不相信爸爸会做那种事情！”
当着人家的面说人家老爸的坏话，碇真嗣虽然不喜欢碇源堂，但是还是有些无法接受琉星的说法。
“信不信，到时候你们就知道了！”