结束了和碇唯的对话，一切彷佛重归于平静。
自从炎山之后，这段时间内意外的没有使徒降临，甚至直到真嗣学校进行修学旅游也是一样，作为德国人的明日香对此感到期待，然而，却被葛城美里以驾驶员必须随时待命的理由阻止了。
虽然明日香对此十分抗拒, 但当葛城美里拿出了那张不算很好的成绩单后，明日香虽然也很不屑，但最终还是选择接受了这个事实。
她其实已经大学毕业了，初中的题目对她来说不算什么，只是语言的问题，毕竟作为在德国成长的明日香, 让她突然熟练的掌握日语确实有些难为人。
碇真嗣和绫波丽对此都没有什么意见，碇真嗣是已经有了心理准备，而绫波丽则完全不在意这个。
现在, 碇真嗣最在意的，还是前段时间和母亲的见面。
这是难以想象的事情，三岁时就失去母亲的他，已经将母亲的容貌忘得差不多了，而碇源堂因为某些原因，将所有关于碇唯的照片都烧了。
而这一次的事件，让碇真嗣整个人都显得精神了许多，虽然没能让母亲从初号机中出来，但和母亲的交流已经让这个少年十分满足，更让他惊喜的是碇源堂对他的态度，一直以来，他驾驶的理由其实就是为了让父亲承认自己，自从那件事之后, 碇源堂对他的态度已经有了变化, 虽然很细微, 但已经让敏感的少年察觉到了。
所以，相比不满的明日香, 碇真嗣已经十分满足了。
绫波丽则是另一种态度, 当她得知关于自己的真相后，却没有任何感情波动，平静的可怕。
或许正是因为成长环境的原因吧，绫波丽对这种事并不在意，但自从奈欧斯带着碇真嗣和碇唯进行交流的时候，她反倒是将注意力转向了零号机。
零号机，是她的专属，相比初号机和二号机来说并不成熟，因为零号机从某种意义上也只是试验品而已。
然而，那一天之后，绫波丽察觉到，自己和零号机之间，似乎存在着某种联系。
即使她都对此感到惊讶，但却将这份惊讶隐藏起来，没有对任何人说，就连李林也是一样。
这一刻，她有了自己的想法。
李林在那事之后也陷入了之前的状态, 解决了炎山之后，他的下一个目标便是拉弗雷谢恩, 不过他现在倒也不似之前那般焦急了。
因为，融合了使徒的炎山自动出现在了第三新东京市，那么吞噬了使徒的拉弗雷谢恩很可能会自己出现在这里。
现在李林要做的只是准备好应付一切可能发生的状况即可。
就这样，时光如水流逝。
短暂的平静过后，第三新东京市先后经历了两大使徒的来袭。
一个是第九使徒雨天使，有着宛如蜘蛛的姿态，可以使用酸解液腐蚀物质，进而入侵地下都市，甚至连的装甲都无法抵挡这种腐蚀，然而，它本身的实力却并不强大，如果不是当时的地下都市因为某些不明原因陷入了停电状态，早就解决了。
但等到碇真嗣他们驾驶出击之后，仅仅是一轮步枪射击就解决了对方。
另一个则是第十使徒空天使，相比第九使徒，空天使的力量更加强大，作为突然出现在印度洋上空的同温层的使徒，有着史无前例的巨大体型，正体几何形态，但却有着许多宛如眼睛的花纹，其本身就是一颗巨大的炸弹。可以将部分身体从大气层中降下，加速以绝对领域攻击，在进攻过程中展现出了学习能力。
而在整体瞄准第三新东京市后开始加速下坠，但却被美里提出的大胆假设所阻止——让三台快速前进到使徒的正下方，同时施展所有的AT力场，并将其阻断。
这就是计划的全部内容。